Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference (한국정보처리학회:학술대회논문집)

  • 2011.11a
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  • Pages.1119-1122
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  • 2011
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  • 2005-0011(pISSN)
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  • 2671-7298(eISSN)
Korea Information Processing Society (한국정보처리학회)
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Analysis on Working Tools for Detecting Splice Junction

Splice Junction 탐색에 특화된 기존 도구들의 분석

  • Kim, Sora (Dept of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Park, TaeWon (Dept of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Choi, SeokMoon (Dept of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Park, Gi-Jeong ;
  • Lee, DoHoon (Dept of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Cho, Hwan-Gue (Dept of Computer Engineering, Pusan National University)
  • 김소라 (부산대학교 컴퓨터공학부) ;
  • 박태원 (부산대학교 컴퓨터공학부) ;
  • 최석문 (부산대학교 컴퓨터공학부) ;
  • 박기정 (국립보건연구원 바이오과학정보과) ;
  • 이도훈 (부산대학교 컴퓨터공학부) ;
  • 조환규 (부산대학교 컴퓨터공학부)
  • Published : 2011.11.11
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Abstract

오늘날에는 HGP(Human Genome Project)로 인해 인간과 같은 고등생물은 높은 비율로, 단백질을 만들어낼 때 유전자 개수를 늘려 나가는 것이 아니라 유전자의 활용도를 높임으로써 다양한 단백질을 만들어낸다 새로운 사실이 밝혀졌다. 이로 인해 alternative splicing에 대한 관심이 높아지고 있다. Alternative splicing의 비중이 높아지며 이에 따라 이를 찾아내기 위한 다양한 방법들이 생겨나고, 이러한 방법 중 하나가 splice junction을 찾아내는 것이다. 본 논문에서는 splice junction 탐색을 위한 도구를 개발하기에 앞서 이미 기존에 존재하는 도구들을 조사하여 해당 도구들이 어떠한 사양과 알고리즘을 사용하는지를 분석 및 비교하였다.

Keywords