한국정보처리학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference)

한국정보처리학회 (Korea Information Processing Society)
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Genbank 분석을 통한 NDSL 연계 서비스 모형 설계 연구

A Study on Design of NDSL Linked Service Model by Analysis of Genbank

  • 안부영 (한국과학기술정보연구원 콘텐츠융합팀 ) ;
  • 이정훈 ((주)킨폭스) ;
  • 김대환 (한국과학기술정보연구원 콘텐츠융합팀 ) ;
  • 신용주 (한국과학기술정보연구원 콘텐츠융합팀 ) ;
  • 최선희 (한국과학기술정보연구원 콘텐츠융합팀 ) ;
  • 신진섭 (한국과학기술정보연구원 콘텐츠융합팀 )
  • Bu-Young Ahn (Content Convergence Team, Korea Institute of Science & Technology Information) ;
  • Jung-Hun Lee (Kinfox Corporation) ;
  • Dea-Hwan Kim (Content Convergence Team, Korea Institute of Science & Technology Information) ;
  • Yong-Ju Shin (Content Convergence Team, Korea Institute of Science & Technology Information) ;
  • Seon-Heui Choi (Content Convergence Team, Korea Institute of Science & Technology Information) ;
  • Jin-Seob Shin (Content Convergence Team, Korea Institute of Science & Technology Information)
  • 발행 : 2008.11.14
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초록

최근 들어 분자생물학의 급속한 발전과 2001년 인간유전체사업의 완료로 인해 전세계적으로 엄청난 양의 유전정보가 공개되었다. 유전자 서열정보는 그 양이 방대하고 다양하기에 데이터베이스 구축 및 분석을 위하여 고성능 컴퓨터 및 정보기술 기법이 필요하다. 그래서 컴퓨터를 활용하여 생물학적 데이터를 수집, 관리, 저장, 평가, 분석하는 연구분야인 생명정보학(바이오인포매틱스)이라는 학문이 지속적으로 발전하고 있다. 이런 생명정보학 발전에 발맞추어 한국과학기술정보연구원(KISTI)에서는 정보기술을 기반으로 한 생명정보 인프라를 구축하여 생명과학 연구자들에게 제공하고 있다. 본 논문에서는 생명정보 데이터베이스중에서 연구자들이 가장 많이 이용하는 유전자 데이터베이스인 Genbank를 활용 및 분석하여 KISTI에서 운영하는 학술논문 제공 사이트인 NDSL(http://scholar.ndsl.kr)과 연계 가능한 서비스 모델을 개발하기 위하여 1) NCBI FTP 사이트에서 Genbank 데이터를 수집하고, 2) Genbank 텍스트 파일을 유전자 기본정보와 참고 데이터베이스로 재구축하며, 3) Genbank refrence 필드에서 논문 및 특허 정보 추출을 통한 새로운 테이블을 생성하여 NDSL과 연계 가능한 서비스 모델을 제안하였다.

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