DOI QR코드

DOI QR Code

부울 대수를 이용한 복합질환의 중요 SNP 찾기

Detection of SNPs involved in the development of complex diseases with the boolean algebra

  • 임상섭 (아주대학교 정보통신 전문대학원) ;
  • 김승현 (아주대학교 병원 알레내과) ;
  • 위규범 (아주대학교 정보통신 전문대학원)
  • Sangseob Leem (Graduate School of Information & Communication, Ajou University) ;
  • SeunghyunKim (Department of Allergy & Rheumatology, Ajou University School of Medicine) ;
  • Kyubum Wee (Graduate School of Information & Communication, Ajou University)
  • 발행 : 2008.11.14

초록

복합질환(complex disease)의 원인과 작용 모델을 찾기 위해 여러 가지 통계적인 방법들과 기계 학습(machine learning)의 방법 등이 사용되고 있다. 소수 SNP의 작용모델을 찾는 방법은 많이 알려져 있지만 다수 SNP의 작용 모델을 효과적으로 찾는 방법은 거의 연구되어 있지 않다. 본 연구에서는 원인 SNP들의 작용을 부울 식(boolean expression)으로 나타내고, 유전 알고리즘(genetic algorithm)을 이용하여 예측 정확도가 높은 부울 식을 구성하였으며 실제 자료와 생성된 자료에 대하여 제안한 모델의 성능을 측정하였다.

키워드