Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)
- 2008.06c
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- Pages.208-211
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- 2008
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- 1598-5164(pISSN)
An Enhanced SW-ARRAY Method for Detecting Copy Number Variations(CNVs)
유전체 단위 반복 변이(CNV) 발견을 위한 개선된 SW-ARRAY
- Moon, Myung-Jin (Dept. of Computer Science, Yonsei University) ;
- Ahn, Jae-Gyoon (Dept. of Computer Science, Yonsei University) ;
- Yoon, Young-Mi (Dept. of Computer Science, Yonsei University) ;
- Park, Chi-Hyun (Dept. of Computer Science, Yonsei University) ;
-
Park, Sang-Hyun
(Dept. of Computer Science, Yonsei University)
- 문명진 (연세대학교 컴퓨터과학과) ;
- 안재균 (연세대학교 컴퓨터과학과) ;
- 윤영미 (연세대학교 컴퓨터과학과) ;
- 박치현 (연세대학교 컴퓨터과학과) ;
-
박상현
(연세대학교 컴퓨터과학과)
- Published : 2008.06.30
Abstract
최근 유전체 단위 반복 변이(CNV)의 중요성이 부각되고 있다. CNV란 DNA가 복제될 때 일부가 만들어지지 않거나 혹은 많이 만들어져 그 양이 차이가 나게 되는 것으로, 인간의 질병이나 형질과 밀접한 관련을 가진다고 알려져 있다. 이에 따라 CNV와 관련된 연구가 활발히 진행되었으며, CNV를 찾기 위한 다양한 방법들이 나오게 되었다. 본 논문에서는 CNV를 찾아내는 대표적인 기법 중 하나인 SW-ARRAY에 대해서 알아보고, 여기에 페널티 값과 점수에 따른 가변 임계값을 적용하여 보정함으로써 기존 SW-ARRAY의 문제점을 해결하는 방법을 제안한다. 이를 실제 Array-CGH 데이터에 적용한 결과 긍정 오류 값이 줄어들어 기존의 방식에 비해 정확한 값을 얻게 되었다.
Keywords