Protein Structure Prediction Using Associative Classification

연관적 분류기법을 이용한 단백질 구조예측

  • Cho Kyung-Hwan (Dept. of Computer Science, Chung Buk National University) ;
  • Lee Heon-Gyu (Dept. of Computer Science, Chung Buk National University) ;
  • Lee Bum-Ju (Dept. of Computer Science, Chung Buk National University) ;
  • Jung Kwang-Su (Dept. of Computer Science, Chung Buk National University) ;
  • Ryu Keun-Ho (Dept. of Computer Science, Chung Buk National University)
  • 조경환 (충북대학교 전자계산학과) ;
  • 이헌규 (충북대학교 전자계산학과) ;
  • 이범주 (충북대학교 전자계산학과) ;
  • 정광수 (충북대학교 전자계산학과) ;
  • 류근호 (충북대학교 전자계산학과)
  • Published : 2006.05.01

Abstract

단백질 구조로부터 단백질 기능을 예측하고자 하는 일은 생명정보학 에서 중요한 이슈 및 연구과제가 되어 왔다. 그 중 단백질의 3 차 구조를 이해하고 분류하는 데에는 계층적인 분류방법을 이용하는 CATH database가 사용되고 있다. 이 논문에서는 CATH database 의 계층적 분류의 특성을 이용하되, 단백질의 3 차 구조가 아닌 단백질 서열로부터 데이터마이닝 기술을 적용, 마이닝 기법 중 순차패턴과 연관적 분류 기법을 이용하여 CATH database 의 계층별 구조 분류 기법을 제안 하였다.

Keywords