Identification and gene expression profiling of chicken Pumilio family, Pum1 and Pum2

Members of the Pumilio are the RNA binding proteins acting as translational repressors and required for germ cell development and asymmetric division. We identified chicken Pum1 and Pum2 that are similar to mouse and human in highly conserved C-terminal RNA-binding domain and eight tandem repeats. The comparative sequence analysis of Pum1 and Pum2 from fly, chicken, mouse and human shows high degree of evolutionary conservation in the homology of the peptide sequence and the structure of PUM-HD (Pumilio homology domain) with similar spacing between adjacent Pum repeats. Also, structures of chicken Pum1 and Pum2 genes are almost identical to those of mouse and human. We revealed that the expression levels of Pum1 and Pum2 were the highest in hatched female gonad among various embryonic tissues, and Pum2 expressed highly in 12-day and hatched gonad by real-time RT-PCR. These results suggest that Pum1 and Pum2 might have an effect on the development of chicken gonad.

Pumilio 유전자는 생식 세포의 발달과 분화에 중요한 역할을 한다고 알려져 있다. 우리는 이러한 Pumilio family인 Pum1, Pum2 유전자를 닭에서 클로닝하여 그 Pumilio homology domain의 구조와 단백질 염기서열이 초파리, 생쥐, 인간과 유사하다는 것을 밝혔고 이를 통해 이 유전자가 진화적으로 보존되어 있다는 것을 증명하였다. 또한 닭의 Pum1과 Pum2 genome 구조 역시 생쥐와 인간 Pum 유전자들의 구조와 일치하는 것을 보여주었다. Real-time RT-PCR 결과 닭의 배아의 여러 조직들 중 Pum1과 Pum2 유전자 모두 부화한 암컷 생식선에서의 발현 수준이 유의적으로 높았고, 특히 Pum2 유전자의 경우 부화한 병아리의 생식선뿐만이 아니라 12일령의 생식선에서도 발현 수준이 높았다. 결과적으로, 다른 동물에서 알려진 바와 같이 닭에서도 Pumilio 유전자들이 생식선 발달에 관여할 가능성이 크다는 것을 알수 있다.