Molecular epidemiological analysis of viscerotropic velogenic Newcastle disease viruses

The study, using sequence analysis and phylogenetic relationship of the fusion protein gene, divided the Korean epizootic isolates of Newcastle disease virus (NDV) into several lineages to determine the molecular epidemiology of the virus. A 695 base pair fragment was amplified by polymerase chain reaction between matrix protein gene and fusion protein gene of 30 Korean NDV isolates, which were isolated from field outbreaks of Newcastle disease between 1949 and 2002. All isolates showed the amino acid sequence 112 R-R-Q/R-K-R116 at the C-terminus of the F2 protein and phenylalanine (F) at the N-terminus of the F1 protein, residue 117. These amino acid sequences were identical to a known virulent motif. The region of the F gene between nucleotides 47 and 435 was compared by phylogenetic analysis. Based on nucleotide sequence, the Korean NDV isolates belonged to genotype III, V, VI and VII corresponding to isolates in 1949, 1982 to 1984, 1988 to 1997, and 1995 to 2002, respectively. These data showed that genotypes of five Korean Newcastle disease epizootics had replaced each other serially (III, V, VI and VII) in chronological order. Further, the five Korean Newcastle disease epizootics were closely related with the Necastle disease panzootics or Newcastle disease epizootics in other countries. Present study showed that the Korean genotype V isolated before 1984 was related with European Newcastle disease epizootics in the 1970s, whereas the Korean genotype VI and VII isolated after 1988 were more closely related with Far East Newcastle disease epizootics, especially Newcastle disease3 epizootics in Japan, Taiwan and China. Since 1988, the genotype VI and VII of Far East origin were dominant in South Korea. That might be due to the increased trade of agricultural products including poultry among Far East Asian countries.

내장친화성 뉴캣슬병 바이러스 한국분리주의 분자역학적 분석 뉴캣슬병 바이러스 한국분리주의 유전자 염기서열과 아미노산 염기서열을 분석한 후 미국, 유럽, 일본, 대만과 중국 등지에서 보고된 뉴캣슬병 바이러스의 유전자와 비교분석을 실시하였다. 1949, 1982-1984, 1988-1997, 1995-2002년도에 분리된 뉴캣슬병 바이러스 한국분리주 들은 각각 유전자형 III, V, VI, VII형에 속하는 것으로 나타났다. 이와 같은 결과는 다섯번의 한국 뉴캣슬병 유행기에 분리된 바이러스의 유전자형이 시대순으로 차례대로 III, V, VI, VII형으로 교체되어 왔음을 의미한다. 계통발생학적 분석 결과, 뉴캣슬병 바이러스 한국분리주중 V유전자형에 속하는 바이러스는 1970년대의 유럽 유행주와 관련성이 있는 반면, 1988년 이후 분리된 VI과 VII 유전자형의 바이러스는 일본, 대만, 중국과 같은 극동아시아의 뉴캣슬병 발생과 관련성이 높은 것으로 나타났다. 따라서 최근에는 극동아시아 유래의 VI과 VII유전자형이 한국분리주의 주류를 이루고 있으며, 이는 극동아시아 국가들간의 축산물과 사람의 교역 및 교류의 증가 때문인 것으로 보인다.