한국생물정보학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference)

한국생명정보학회 (Korean Society for Bioinformatics)
권호 표지

Proteinca : 단백질-단백질 상호작용 네트워크의 분석 및 가시화 시스템

Proteinca : A System for Analysis/Visualization of Protein-Protein Interaction Networks

  • Yoon, Ji-Hyun (Department of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Jin, Hee-Jeong (Department of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Cho, Hwan-Gue (Department of Computer Engineering, Pusan National University)
  • 발행 : 2004.11.04
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초록

단백질-단백질 상호작용(PPI :Protein-Protein Interaction) 데이터는 생물체가 어떠한 메커니즘으로 생명을 유지하는지에 대한 정보를 담고 있다. 최근에는 생물학자들의 실험에 의해 많은 데이터가 축적되어 있으며, 데이터베이스로 구축되어 인터넷에 공개되어 있다. PPI 데이터는 단백질를 노드(node)로, 상호작용은 에지(edge)로 갖는 그래프(Graph) 구조로 표현 가능하다. 본 논문에서는 사용자가 PPI 데이터를 쉽게 가공하고 분석할 수 있도록 그래프 이론 기반에 기반하여 구현한 Proteinca(PROTEin INteraction CAbaret) 시스템에 대해 소개한다. Proteinca에 대한 자세한 정보는 http://jade.cs.pusan.ac.kr/${\sim}$proten에서 볼 수 있다.

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