Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference (한국생물정보학회:학술대회논문집)
- 2004.11a
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- Pages.191-202
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- 2004
Scaffold-Based Classification of Chemical Library in Korea Chemical Bank
한국화합물은행 화합물 라이브러리의 Scaffold 별 분류
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- Choi, Yeon-Joo (Korea Research Institute of Chemical Technology) ;
- Kim, Ju-Young (Korea Research Institute of Chemical Technology) ;
- Heo, Mi-Young (Korea Research Institute of Chemical Technology) ;
- Kim, Sun-Woo (Korea Research Institute of Chemical Technology) ;
- Kim, Sun-Ho (Korea Research Institute of Chemical Technology) ;
- Kim, Sung-Soo (Korea Research Institute of Chemical Technology) ;
- Chae, Chong-Hak (Korea Research Institute of Chemical Technology)
- Published : 2004.11.04
Abstract
한국화합물은행(KCB)에서 보유중인 12만 개의 화합물을 주요 골격에 따라 분류하고, 4 가지 protease 작용점에 대한 활성도와 골격사이의 관계를 조사하였다. 화합물들은 합성기관의 합성 목적과 주요 고리골격 등을 고려하여 분류되었으며, 이를 이용하여 scaffold 분류를 위한 분류 계통도를 작성하였다. 화합물들은 이 계통도에 따라 7 가지의 race, 168 tribe, 493 parent, 439 child, 325 grandchild 등 1,087개의 scaffold로 분류되었으며, 각 race 및 scaffold 별 골격의 개수는 고르게 분포되었다. 골격별 분류 시스템을 이용하여 4 가지의 protease에 대한 활성도와 골격 간의 상관관계를 조사한 결과, Protease C에 대하여 몇 가지 골격이 활성이 뛰어남을 보였다.
Keywords