인공신경망을 이용한 세포 주기상의 전사 조절 모티프 탐색

Transcriptional Regulatory Motif identification in Cell Cycle using Artificial Neural Networks

  • 이제근 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센타) ;
  • 정제균 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센타) ;
  • 장병탁 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센타, 서울대학교 컴퓨터공학부)
  • 발행 : 2004.10.01

초록

생체 내의 모든 기능은 유전자 발현에 의해 결정된다. 유전자 발현은 않은 인자들에 의해 조절되며, 이러한 조절 과정에 따라 유전자 발현량이 결정되는 것이다. 세포 주기 역시 유전자 발현과 밀접한 연관성을 가지고 있다. 본 논문에서는 효모에서 세포 주기의 각 단계와 관련된 유전자들의 분석을 통해서 세포주기를 조절하는데 있어서 중요한 역할을 수행하는 전사 조절 모티프들이 무엇인지를 찾아보았다. 주요 모티프의 추출은 인공신경망 모델을 학습하고. 입출력 에러 분석을 통하여 이루어진다. 그 결과 MCB 등 기존의 실험 결과를 통하여 세포주기에 관련이 있다고 알려진 모티프들이 높은 점수를 보인다는 것을 알 수 있었고. 그 외에 세포주기의 각 단계에서 유전자 발현에 중요한 역할을 수행할 것으로 예상되는 다른 모티프들도 예측해볼 수 있었다.

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