Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2004.04b
  • /
  • Pages.280-282
  • /
  • 2004
  • /
  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

An XML-Based Analysis Tool for Gene Prediction Results

XML 기반의 유전자 예측결과 분석도구

  • 변상희 (울산대학교 컴퓨터정보학과) ;
  • 윤형석 (국립보건원유전체연구부 역학정보) ;
  • 안건태 (울산대학교 컴퓨터정보학) ;
  • 박양수 (울산대학교 컴퓨터정보학) ;
  • 이명준 (울산대학교 컴퓨터정보학과)
  • Published : 2004.04.01
Download PDF
⟨ Previous Next ⟩

Abstract

염기서열의 분석이 유전체에 대한 연구를 가능하게 해 줄 수 있다는 것이 밝혀짐에 따라 다양한 생명체에 대한 유전체 염기서열 분석 도구의 개발이 활발히 진행되었다. 이러한 유전자 예측 도구들은 고유의 단순 텍스트 형식으로 결과를 제공하므로 사용자는 결과를 분석하고 통계정보를 산출하는데 많은 노력이 필요하다. 본 논문에서는 유전자 예측결과를 보다 효율적으로 표현하고 분석하기 위한 XML 기반의 분석도구를 개발하였다. 개발된 시스템은 유전자 예측결과를 효과적으로 표현하는 GenStructML, 이 정보를 분석한 GenPredML과 PredAccuracyML로 구성되어 있다. GenPredML과 PredAccuracyML은 GenStructML에 대하여 뉴클레오티드 수준(nucleotide level), 엑손 수준(exon level) 그리고 신호 수준(signal level)에서의 예측 정확도(Accuracy)를 계산하고 Genbank의 정보와 비교하여 통계정보를 산출함으로써 보다 자세한 정보를 제공한다.

Keywords