XML기반의 Rice 60K DNA Chip 데이터베이스 시스템의 구현

Implementation of Rice 60K DNA Chip Database system based on XML

  • 박영배 (명지대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 안기영 (명지대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 남백희 (명지대학교 생명과학과) ;
  • 이태호 (명지대학교 생명과학과) ;
  • 최형인 (서울대학교 수리과학부)
  • Park, Young-Bae (Dept. of Computer Engineering, Myong-Ji University) ;
  • Ahn, Gi-Young (Dept. of Computer Engineering, Myong-Ji University) ;
  • Nahm, Baek-Hie (Division of Bioscience and Bioinformatics, Myong-Ji University) ;
  • Lee, Tae-Ho (Division of Bioscience and Bioinformatics, Myong-Ji University) ;
  • Choi, Hyeong-In (School of Mathematical Science, Seoul National University)
  • 발행 : 2003.11.14

초록

본 논문은 Rice 60K DNA Chip의 실험데이터를 기반으로 한 데이터베이스의 구축과 XML기반 검색시스템을 설계 및 구현에 대해 설명한다. 본 시스템은 실험 데이터를 저장하기 위하여 RDBMS 를 사용하고 Chip 데이터를 검색하기 위해 XML 기반의 검색시스템을 사용한다. 이를 위해 일반 속성으로 저장될 수 있는 데이터들은 데이터베이스의 테이블의 속성 값으로 저장하고, XML 기반 검색시스템을 통해 검색할 수 있도록 한다. 그리고 BLAST내용을 기반으로 하는 데이터는 테이블을 별도로 만들어서 검색이 가능하도록 한다.

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