Similarity Analysis between Total RNA and Amplified RNA Using Entropy Measure

엔트로피 척도를 이용한 전체 RNA와 중폭 RNA의 유사성 분석

암의 조기 발견 및 예후 예측을 위하여 마이크로어레이 데이터를 이용할 수 있다. 하지만 이를 분석하기 위해서는 40${\mu}g$ 이상의 RNA 샘플이 필요한데, 실제 임상 시료를 사용하는 경우 요구되는 충분한 양을 얻기가 어려운 단점이 있다. 따라서 소량의 RNA 샘플을 채취한 후 PCR 증폭 과정을 통하여 요구되는 양의 샘플을 얻을 수 있는 RNA 증폭 방법이 시도되고 있고, 이를 마이크로어레이 실험에 이용하기 위해서는 증폭 전후의 유사성이 보장되어야 한다. 본 논문에서는 증폭 RNA와 전체 RNA의 유사성을 비교하기 위한 새로운 방법으로 엔트로피 기반의 방법을 제시한다. 아울러 다양한 조건에 따라서 엔트로피값을 측정하여 세포주와 조직에서 엔트로피 값이 어떻게 사용될 수 있는지 체계적인 분석을 하였다.