Evolutionary Algorithm to Construct Regulatory Genetic Network

유전자 조절 네트웍 구축을 위한 진화알고리즘 기법

  • 정제균 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터) ;
  • 오석준 (서울대학교 바이오정보기술 연구센터) ;
  • 남진우 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터) ;
  • 장병탁 (서울대학교 생물정보학 협동과정, 서울대학교 바이오정보기술 연구센터, 서울대학교 컴퓨터공학부)
  • Published : 2003.04.01

Abstract

유전자 네트웍 구축은 다양한 생물학적 실험 결과를 통하여 유전자간의 관계를 모델링하는 작업이다. 현재 유전자 섭동(perturbation) 실험은 대규모 유전자 조절 네트웍(regulatory genetic network) 구축을 위한 중요한 데이터로 인식되고 있다. 하지만 유전자 섭동 실험에 의한 결과는 하나의 유전자가 다른 유전자에 대하여 직접적 또는 간접적인 영향을 주는 지에 대한 정보를 파악하기 어렵다. 본 논문은 이러한 문제점을 해결하기 위하여 섭동 실험에 의한 결과로부터 생성된 복잡한 유전자 관계를 실제 생물마적 네트웍 형태로 단순화시키는 진화알고리즘을 제안하고자 한다. 실험은 진화 알고리즘이 임의의 복잡한 네트웍에 대하여 다양한 후보 네트웍 해를 제시해 줄 수 있는 결과를 보여 주고 있다.

Keywords