DNA secondary structure prediction for effective probe design

효과적인 프로브 설계를 위한 핵산 이차구조 예측

  • 장하영 (서울대학교 공과대학 컴퓨터공학부 바이오지능 연구실) ;
  • 장병탁 (서울대학교 공과대학 컴퓨터공학부 바이오지능 연구실)
  • Published : 2002.10.01

Abstract

DNA 칩에서 사용되는 프로브를 가장 효과적으로 설계하기 위해서는 상보결합을 위한 1차구조뿐만이 아니라 열역학적인 움직임과 함께 2차구조가 고려되어야만 한다. 그러나 핵산의 기능에 큰 영향을 미치는 2차구조에 대한 연구는 일찍부터 진행되어 왔지만, 상대적으로 DNA에 대한 연구는 크게 미흡한 것이 현실이다. 이에 우리는 유전자 알고리즘을 이용한 핵산의 이차구조 예측을 통해서 보다 효과적인 프로브의 설계를 위한 방법을 고안했다.

Keywords