한국정보과학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korean Information Science Society Conference)
- 한국정보과학회 2002년도 봄 학술발표논문집 Vol.29 No.1 (B)
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- Pages.73-75
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- 2002
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- 1598-5164(pISSN)
공간객체 모델 기반 단백질 3차 구조 모델링
Modelling of three Dimensional Structure in Protein based on Spatial Object Model
- Han, Yu (Database Laboratory,Chungbuk National University) ;
- Park, Seng-Hee (Database Laboratory,Chungbuk National University) ;
- Lee, Sun-Hee (Database Laboratory,Chungbuk National University) ;
- Ryu, Keun-Ho (Database Laboratory,Chungbuk National University)
- 발행 : 2002.04.01
초록
PDB에서 제공하는 단백질 3차원 고분자결정 구조에 대한 플랫파일은 인자들의 좌표, 서열정보, 실험정보 및 참조 정보가 포함된다. 이러한 정보를 포함하고 있는 플랫파일로부터 필수적인 구조정보 및 서열정보 등의 효율적인 검색을 위해서는 이러한 데이터를 추출하여 데이터베이스 구축이 요구되며 이 때 단백질 구조 및 서열 정보와 실험 및 탐조 정보의 관계에 대한 모델링이 중요하다. 따라서 이 논문에서는 PDB에서 제공하는 플랫파일들의 엔트리들을 분석하고 3차원 공간 객체의 기하적 특성을 갖는 단백질 3차 구조를 공간객체로 표현하고 공간객체 모델을 적용하여 모델링한다. 이렇게 함으로써 단백질 3차 구조 분자를 구성하는 인자 및 구조 정보 검색이 가능하며 위상 및 기하 연산자글 이용하여 단백질 구조 분석에 활용할 수 있다.
키워드