Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2002.04b
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  • Pages.73-75
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  • 2002
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Modelling of three Dimensional Structure in Protein based on Spatial Object Model

공간객체 모델 기반 단백질 3차 구조 모델링

  • Han, Yu (Database Laboratory,Chungbuk National University) ;
  • Park, Seng-Hee (Database Laboratory,Chungbuk National University) ;
  • Lee, Sun-Hee (Database Laboratory,Chungbuk National University) ;
  • Ryu, Keun-Ho (Database Laboratory,Chungbuk National University)
  • 한욱 (충북대학교 데이터베이스 연구실) ;
  • 박성희 (충북대학교 데이터베이스 연구실) ;
  • 이순희 (충북대학교 데이터베이스 연구실) ;
  • 류근호 (충북대학교 데이터베이스 연구실)
  • Published : 2002.04.01
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Abstract

PDB에서 제공하는 단백질 3차원 고분자결정 구조에 대한 플랫파일은 인자들의 좌표, 서열정보, 실험정보 및 참조 정보가 포함된다. 이러한 정보를 포함하고 있는 플랫파일로부터 필수적인 구조정보 및 서열정보 등의 효율적인 검색을 위해서는 이러한 데이터를 추출하여 데이터베이스 구축이 요구되며 이 때 단백질 구조 및 서열 정보와 실험 및 탐조 정보의 관계에 대한 모델링이 중요하다. 따라서 이 논문에서는 PDB에서 제공하는 플랫파일들의 엔트리들을 분석하고 3차원 공간 객체의 기하적 특성을 갖는 단백질 3차 구조를 공간객체로 표현하고 공간객체 모델을 적용하여 모델링한다. 이렇게 함으로써 단백질 3차 구조 분자를 구성하는 인자 및 구조 정보 검색이 가능하며 위상 및 기하 연산자글 이용하여 단백질 구조 분석에 활용할 수 있다.

Keywords