A Technique for Abstract Representation of Protein Tertiary Structure

단백질 3차 구조의 추상적인 표현기법

  • 김진홍 (울산대학교 컴퓨터·정보통신학부) ;
  • 안건태 (울산대학교 컴퓨터·정보통신학부) ;
  • 변경익 (울산대학교 컴퓨터·정보통신학부) ;
  • 윤형석 (울산대학교 컴퓨터·정보통신학부) ;
  • 이수현 (창원대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 이명준 (울산대학교 컴퓨터·정보통신공학부)
  • Published : 2001.10.01

Abstract

오늘날 인간 유전체 프로젝트(Human Genome Project)의 완성은 인간의 모든 유전자 서열정보를 제공하게 되었으며, 이러한 데이터를 바탕으로 생명현상과 관련된 산업 및 연구가 각광받게 되었다. 특히 생명체의 특정 기능을 파악하기 위한 단백질 3차 구조에 대한 연구가 활발히 진행중이다. 본 논문에서는 단백질 3차 구조를 추상적으로 기술 할 수 있는 표현기법을 기술한다. 제안된 표현기법은 단백질 2차 구조요소($\alpha$-나선구조와 $\beta$-병풍구조)를 이용하여 인접한 구성요소간의 접힘(folding)에 대한 관계를 기술하여 추상적인 단백질 3차 구조를 표현한다. 제안된 표현기법으로 기술된 추상적 단백질 3차 구조 표현은 단백질 구조에 대한 보다 빠른 이해와 다른 단백질 구조와 비교될 수 있는 장점을 지닌다.

Keywords